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癌症全基因组重测序(WGS)
全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)是利用高通量测序平台对人类不同个体或群体进行全基因组测序,并在个体或群体水平上,全面挖掘DNA水平的遗传变异,为筛选癌症驱动基因,研究癌症发病机理提供重要信息。
1.技术优势:CNV和SV检测;病毒整合位点检测;非编码区突变检测;有效数据覆盖均一;测序周期短。
2.平台优势:HiSeq X Ten测序平台支持。
3.技术路线:
4.技术参数:
? 样本要求
样品类型:DNA样品;
样品总量:≥1.0ug DNA(提取自新鲜及冻存样本);
≥1.5ug DNA(提取自FFPE样本);
样品浓度:≥20 ng/ul;
? 捕获平台:Agilent SureSelect Kit;
? 测序平台:HiSeq X Ten;
? 测序策略:HiSeq PE150;
? 测序深度:肿瘤癌组织(50X),癌旁组织/血液样本(30X),遗传病(30~50X);
? 数据量:1.8 Tb;
? 项目周期:48个自然日。